Jeden rok po událostech se 10 miliardami jenů začíná Kazuma Kiryu budovat klidný život s Harukou Sawamurovou. Brzy je však vytržen z této idyly, když hrozba atentátu vyhrožuje rozsáhlou válkou mezi klanem Tojo a aliancí Omi. Kiryu, Drak z Dojimy, musí cestovat do Sotenbori v Osace a pokusit se vyjednat mír mezi rivaly, ale Ryuji Goda, známý jako Drak z Kansai, udělá všechno pro to, aby začala válka. V tomto světě může být pouze jeden drak.
Yakuza Kiwami 2 byla znovu postavena od základu a používá Dragon Engine k aktualizaci jednoho z výrazných dílů série do moderního klasického pojetí. Hráči si mohou zahrát oblíbené minihry, včetně aktualizovaných verzí simulátoru Cabaret Club a tvorby klanu, nebo vyzkoušet úplně nové přídavky, jako je golf bingo a Toylets. Novinkou v Kiwami 2 je také 'Majima Saga', která přináší příběh, kde si hráči zahrají za Goru Majimu a odhalí události předcházející hře.
